Cell Research:肖俊宇/谢晓亮合作发现针对新冠突变株的强效全人源广谱中和抗体一组

2021-10-18 20:29:03 来源:
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随着新冠病原体在全球性以外的流行,凋亡株不断涌现。全球性卫生组织先后将4种凋亡株定义为“更为严重的凋亡株(Variant of Concern, VOC)”:B.1.1.7(Alpha)、B.1.351(Beta)、P.1(Gamma)、以及B.1.617.2(Delta)。这些凋亡株的传播给全球性性的抗疫指导带来相当程度挑战,筛选针对这些新型变异病原体的低活性当中和自体球蛋白也迫在眉睫。

近日,复旦大学生物医学学院、北京期望基因诊断低精尖国际化当其中心(ICG)、北大清华联合当其中心(CLS)肖俊宇和谢晓亮课题组携手,在 Cell Research 上发表了篇名:Structures of SARS-CoV-2 B.1.351 neutralizing antibodies provide insights into cocktail design against concerning variants 的研究工作文章。

在前期研究工作当中,谢晓亮制作团队通过研究新冠长年康复者以及疫苗接种者对B.1.351凋亡株的自体需要的话情况下,发现了一组可以有效当中和 B.1.351 凋亡株的单克隆自体球蛋白(Cao et al., Cell Research 31:732-741, 2021)。

本指导更进一步研究了这些当中和自体球蛋白的分子结构的系统和筛选情况下。首先,通过假病原体当中和检验,发现BD-812和BD-836两株自体球蛋白兼具比较低的活性,对于B.1.351假病原体的当中和均接近pM水准。低分辨单颗粒冷冻电镜研究工作表明,BD-812和BD-836分别混合在B.1.351凋亡株刺突细胞受体混合残基(RBD)的左右两肩,兼具无论如何互不抑制的混合表位,且都能直接阻碍RBD与ACE2受体的混合。尤其重要的是,BD-812和BD-836与RBD的混合均受Delta凋亡株当中L452R和T478K三处凋亡位点的影响,假病原体检验也表明它们均可有效的对Delta凋亡株进行当中和。

该指导还研究了其他自体球蛋白凋亡B.1.351刺突细胞的的系统。BD-821和BD-771混搭与上述BD-812/ BD-836的混合模式颇为相似,也均对Delta凋亡株兼具有效的当中和活性;但与BD-812相比,BD-821在RBD上覆盖的图形相当大,解释了其相比之下BD-821较弱的当中和活性。BD-813混合在RBD的肩部,能直接阻断与ACE2的混合,也保持稳定了对Delta凋亡株的活性。BD-744、BD-667和BD-804则混合在RBD的“胸膛(chest)”上,与ACE2的混合表位没有交错,但这些自体球蛋白的表位都关乎Leu452位点,Delta凋亡株对它们产生了严重的逃逸。显然,Delta凋亡株当中出现的L452R凋亡将会使很多凋亡这一地带的当中和自体球蛋白失效。

凋亡新冠病原体B.1.351凋亡体当中和自体球蛋白的分子结构的系统

总之,该研究工作系统研究了一系列凋亡B.1.351刺突细胞的全人源化当中和自体球蛋白,并依据在结构上电子邮件研究了其混搭方针和对于Delta凋亡株的需要的话情况下。特别值得一提的是,来自长年康复者的BD-812/BD-836自体球蛋白混搭表现比较引人注目,对Alpha、Beta、Kappa、Delta等凋亡株均简介pM层级的活性,有望带入针对新冠病原体凋亡株的候选药物分子结构。

肖俊宇研究工作员、谢晓亮客座教授和复旦大学生物技术前沿国际化当其中心(BIOPIC)曹云龙博士为本文章的合作通讯译者。复旦大学生物医学学院杜硕、刘谱橙、张志莹为该文章的合作第一译者。当中国食品药品检定研究工作院王佑春、黄维金制作团队为假病原体当中和检验提供了大力默许。该研究工作得到细胞质与寄生植物基因研究工作国家所全面性检验室、国家所全面性研发计划、国家所自然科学基金委、复旦大学生物医学学院启东产业国际化基金的默许。

独有中有:

Du, S., Liu, P., Zhang, Z. et al. Structures of SARS-CoV-2 B.1.351 neutralizing antibodies provide insights into cocktail design against concerning variants. Cell Res (2021). https://doi.org/10.1038/s41422-021-00555-0.

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